Fauna

Mamíferos

 En la RNFFT se encuentran registradas 62 especies de mamíferos, entre las más representativos se encuentran: El mono silbador (Cebus libidinosus), taitetú (Pecari tajacu), puma o león (Puma concolor), tejón (Nasua nasua), jochi (Dasyprocta punctata), tatú o quirquincho (Dasypus novemcinctus) y la raposa (Procyon crancrivorous) y en menor cantidad se encuentran la juca (Tremarctos ornatus), taruca (Hippocamelus antisensis) y el tigre (Panthera onca).

 Aves

De acuerdo a su de Plan de Manejo se han registrado 242 especies de aves, se incluyen a 47 familias, representando el 57% de las especies de Tarija.

En los bosques húmedos se tienen especies como el pato de torrentes (Merganetta armata), el surucuá o aurora (Trogon curucui), Knipolegus signatus, Pyrrhomyias cinnamomea, Mecocerculus leucophrys, Troglodytes solstitialis, Thypopsis ruficeps, Chlorosphingus ophtalmicus, Atlapetes torquatus, Amazona Tucumana, Eriocnemis glaucopoides, Myioborus brunniceps, Atlapetes fulviceps y Poospiza erythrophrys.

En el bosque semi-húmedo a húmedo montañoso se puede encontrar a las siguientes especies: cóndor (Vultur gryphus), Amazona tucumana, Colibri coruscans, Sapho sparganura, Adelomyia melanogenys, Eriocnemis glaucopodes, Turdus chiguanco, Atlapetes fulviceps y el carpintero que se encuentra en el logo de la RNFF Tariquía (Camphephilus leucopogon).

En los pastizales de altura existen especies de puna y altoandinas como Phalcoboenus megalopterus, Colaptes rupicola, Muscisaxicola alpina, Upucerthia andaecola, Phrygilus unicolor, Aratinga mitrata, Bolborhynchus aymara, Colibri coruscans y Octhoeca frontalis.

En Bolivia existen 16 especies de aves endémicas, de las cuales tres se encuentran dentro de la RNFFT Poospiza boliviana, Asthenes heterura y Scytalopus zimmeri.

 Anfibios y Reptiles

 Se han encontrado 47 especies de herpetozoos de las cuales 28 son anfibios y 19 son reptiles. Entre las especies se pueden nombrar Buffo aff. veraguensis, Hyla aff marianatae, Gastrotheca aff marsupiata, Melanophryniscus ruberventris y Pleuroderma cf borelli, las serpientes Liophis sp., Colubridae y Tachymenis peruviana.

Peces

 El número de especies registradas es de 64, de las cuales 55% corresponde a los Characiformes, 44% a syluriformes y 1% a los Cyprinodontiformes. Entre las especies registradas se encuentran los Salminus maxillosus (dorado), Prochilodus lineatus (sábalo), Paulicea lutkeni (robal), Pseudoplatistoma fasciatum (surubí), Pimelodus spp (bagre) y Colossoma mitrei (pacú).

Las especies amenazadas son el sábalo, el dorado por uso comercial y deportivo, además Acrobrycon tarijae y Oligosarcus bolivianus, más que todo por los efectos de la contaminación minera.