Fauna

Mamíferos

En el ANMIN Apolobamba se tienen registradas 90 especies, 69 géneros y 31 familias de mamíferos.

Entre las especies de mamíferos más importantes se tiene a: Vicugna vicugna (vicuña), el Leopardus jacobita (Titi o gato andino), Lagidium viscacia (viscacha), Lycalopex culpaeus (zorro Andino) y Puma concolor (puma), Tremarctos ornatus (Jucumari), Hippocamelus antisensis (Taruka o venado andino), Odocoileus peruvianus (Lluicho), Mazama chunyi (Chunyi taruka), Pecari tajacu (Taitetú) Ateles chamek (Marimono), Cebus libidinosus (Silbador), Aotus azarae (Mono nocturno), Sciurus spadiceus (Ardilla colorada), Sylvilagus brasiliensis (Tapeti), Dasyprocta punctata (Sari), Cuniculus paca, (Jochi pintao), Dasypus sp. (Armadillo), Priodontes maximus (Pejichi), Bradypus variegatus (Perezoso), Tamandua tetradactyla (Hormiguero), Panthera onca (Tigre), Leopardus sp. (Tigrecillo), Nasua nasua (Tejón), Puma concolor (puma), Conepatus chinga (zorrino), Chroeomys jelskii, Auliscomys sublimis, Calomys lepidus, Chinchillula sahamae. Akodon boliviensis, Chroeomys jelskii, Auliscomys pictus, Auliscomys sublimis.

Entre las especies de mamíferos pequeños se tiene al Marmosops cf. dorothea además de ser endémica de Bolivia; Lestoros inca gracilis, Thomasomys oreas y Thomasomys daphne.

Aves

 Se tiene registradas 508 especies de aves, 310 géneros y 55 familias. En el sector del altoandino entre los 4.800 y 5.500 m se encuentran especies como el Attagis gayi, Asthenes humilis, Muscisaxicola juninensis, Diuca especulifera, Phrygilus unicolor y Carduelis atrata, Choephaga melanoptera, Vultur gryphus, Phalcoboenus megalopterus, Oreotrochillus estella, Cinclodes fuscus, Petrochelidon andecola, Muscisaxicola albifrons, Phrygilus unicolor.

En la región de la Puna  la avifauna se caracteriza por ser mayormente de hábitos terrestres, en este hábitat se identifican unidades como los bofedales donde existen Nycticorax nycticorax, Plegadis ridgwayi, Lophonetha specularoides, etc.; la pampa con presencia de Circus cinereus y Anthus furcatus, Chloephaga melanoptera, Buteo poecilochrous, Phalcoboenus megalopterus; y en las zonas altas de la cordillera el Thinocoridae, Podicipedidae, Phoenicopteridae, Anatidae, Rallidae, Charadridae, Scolopacidae, Pandion haliaetus, Tringa spp., Pluvialis dominica, P. squatarola, Actitis macularia, Calidris spp., Steganopus tricolor, Columbina picui, Elaenia albiceps, Muscisaxicola flavinucha y Hirundo rustica.

 Herpetofauna

 Se han registrado 11 especies de reptiles (3) y anfibios (8) (SERNAP, 1.997), entre las cuales se encuentran:

• Anfibios más importantes: Atelopus tricolor (Bufonidae), Rhinella marinus (Bufonidae), Epípedobates pictus (Dendrobatidae), Gastrotheca marsupiata (Hylidae), Hyla rhodopepia (Hylidea), Phyllomedusa boliviana (Hylidae), Pleurodema cinereum (Leptodactylidae), Phrynopus laplacai (Leptodactylidae), Telmatpbius verrucosos (Leptodactylidae).
• Reptiles más importantes: Proctopours guentheri (Gymnophthalmidae), Liolaemus alticolor (Tropiduridae), Leptotyphlops albifrons (Leptotyphlopidae), Crotalus durissus (Viperidae), Micrurus trontifasciatus (Elapidae).

 Peces

 Se han registrado 4 especies de peces, entre las cuales se encuentran: carache (Orestias sp) suche o maure (Trichomycterus sp), Characidae (Hemibrycon cf. Beni), Trichomycterus sp. y la trucha (Oncorhynchus aguabonita) como especie introducida.